陆地上围剿怪兽的战斗是如火如荼进行着，与之相比，海上的战斗更为激烈。在确定了怪兽出现的海域后，海军舰艇从四面八方围了过来。继185号舰后，又有两艘东海舰队，舷号为187、189的052型驱逐舰和两艘舷号为610、612的056型护卫舰相继出现在海卫市海域，加上原来就在这一海域巡逻的，吨位较小的快艇，已经有近十艘军舰汇聚在一起，战斗力足够进行一场大海战了。
担任海上临时指挥的，是最先发现怪兽踪迹的185号驱逐舰。185舰的舰长徐永源大校是位身材魁梧，相貌堂堂的中年人，由于长年累月在大海里漂泊，皮肤被晒得黑里透红。一直以来，国家对海军的建设是相当重视，每年都会举办无数次各种类型的军事演习，每次演习都要求尽量贴近实战，因此就算是在和平年代，徐永源和他的舰艇也不缺乏作战经验。
可这次不同，在海洋里与怪兽作战，是世界军事史的第一次，没任何经验可借鉴。中国军人有着钢铁般的意志，自打穿上军装的那一刻起，代表的就是国家与人民利益。捍卫国家领土完整，保障社会安定，是军人神圣的职责。与来犯之敌战斗，是每个军人必尽的义务，有经验固然好，就算没经验他们也不会退缩。做为一名优秀指挥官，徐永源保持着与以住一样的冷静，他审时度势，决定采用对付潜艇的办法来对付潜伏在海底的怪兽。
在深海里与怪兽战斗的难度，远比在陆地上与怪兽战斗的难度要大上许多，052型驱逐舰是中国最先进的水面舰船之一，可是说整艘舰就是一个武器平台，上面满载各型号武器，对空对海的都有，就连对付潜艇的导弹都有两种。可惜这些武器对钢铁制造的舰船才有用，怪兽的身体是血肉构成，隐匿在深水中灵活游动，导弹根本没办法锁定它们。
现在的战斗一点不对等，就如一个携带上刀、枪、驽、剑等各式武器的武士，却遭到一只小蚊子欺负的那样，尽管装备多，可除了巴掌，其他武器根本用不上。再加上人家根本不跟你接触，灵活地绕着圈子逗你玩，让你徒有一身力气也干着急。
无奈之下，舰队只能采用最原始，也是效能最为低下的办法，用深水炸弹炸。深水炸弹的准确性不高，作战效率非常低下，只能依靠数量来弥补。他指挥着所有舰艇，把船上装载的深水炸弹不要钱似的往海里扔，此时海底里的怪兽数量众多，舰船上的声纳显示器上铺满红点，投弹时基本都不需要瞄准。不但海上的舰船在攻击，岸上的海航大队还派出了两架的大型轰炸机前来助阵，一时间海卫市附近海面上到处都是轰隆隆的爆炸声，深水炸弹爆炸时涌起的巨浪，冲得在这一海域航行的舰船都是摇摇晃晃的，像是航行在十级风暴的中央。
舰队加轰炸机都炸了半天了，效果并不理想，海面上只浮起少量的怪兽尸体，声纳显示器上的红点数量仍然不见减少。
舰队的攻击激起了海底怪兽的反击，海面上出现了长长的触须和半潜在水面下，黑长的海怪身影。军舰除了导弹之外还有舰炮和火箭等近战武器。做为价格以亿来计算的舰船的最后防卸力量，军舰装备的舰炮无论是射速、还是攻击力均比陆地火炮强。见到怪兽上浮到了水面，徐舰长命令各舰拉开安全距离，用舰炮进行攻击。
052型驱逐舰船首的100mm口径速射炮，以20发/分钟的速度射向从海里伸出来的触须。其他舰艇的火炮口径比052型驱逐舰的较小，导弹快艇舰首的火炮口径只有30mm，但快艇上的火炮射速更快，400发/分钟的炮弹击打在海面上，形成朵朵怒放的花朵。海怪生命力顽强，升出海面的触须被炮弹射中，从中折断成几截，掉落在海里依然如蛇一般的在蠕动。
海洋的面积广，资源丰富，特别是深海地区，受到人类的污染几乎为零，因此海底怪兽的进化层度远比陆地怪兽的更加完美，层级也更为的高级。这次攻击海卫市的的海底怪兽里面就有进化过五次的怪兽，他们的实力才恐怖。
这时有怪兽冲着一艘快艇吃水线下的船体撞去，撞击快艇的就是一头经过了五次进化的“种子”。这头“种子”外形像与普通鲸鱼相似，但有又不同，“种子”的头部巨大，高高隆起的脑袋仿佛像是长着一个肉瘤，躯体比快艇还要长一倍。五进鲸鱼“种子”速度很快，半潜在海面上，如一艘急速前行的潜水艇一般，涌起层层波浪，在他的躯体在与导弹快艇接触时，巨大的撞击力击起了滔天巨浪，导弹快艇被撞得整个船体抬出水面，位于吃水线下的龙骨裂开了一个大大的缺口。等导弹艇再次掉落回大海时，海水灌入的密封舱，导弹快艇倾斜的船弦都与海面连接到了一起。
鲸鱼攻击完后转身潜入海底，离开时，他那能遮盖住半个天空的巨大尾鳍露出水面，重重在拍打在海面上，再次掀起了一道数十米高的巨浪，把已经倾斜导弹快舰彻底的掀翻，整条龙骨露出海面，稍稍停顿一会儿，又慢慢地向大海深处滑去。
看到已方舰艇被海怪击沉，徐永源心中甚为震惊，导弹快艇再小也有几百吨重，可没想到被海怪一次撞击就击沉，对于对手，他有了新的认识。他赶紧下令所有小型舰艇在战斗中要与海怪保持距离，注意自身的安全。同时他又命令185号驱逐舰靠上即将沉入大海的导弹快艇，尽力挽救落水官兵。可当1驱逐舰靠近时，导弹快艇已没入海底，这片海域里面出现了大片海怪，密砸砸交集在一起，摆动着黑魆魆的背脊不停蠕动，瞬息间，导弹快艇上的21位官兵全部葬身于海怪腹中。看到这样的惨境，徐永源悲愤填膺，怒火中烧，命令着舰上的战士对把剩下的深水炸弹全部投入到这片海域，反潜火箭也如雨点般的射击，刹那间，海面上又是一道道巨浪涌现。
怪兽似乎找到舰队弱点，又有导弹快艇受到围攻，一艘导弹快艇被两条几十米长的海怪缠绕着，正在向海底拉，另一艘052型驱逐舰187号正在解救。见情况紧急，徐永源顾不上报仇，命令自己的舰船赶去增援。
徐永源站在驾驶室边的廊桥上，透过望远镜察看着遇险的导弹快艇，那是什么样的怪兽呀，长长的身躯像蛇一般的缠绕在导弹快艇的舰首和舰尾上，根本不管快艇上士兵射出的子弹，导弹快艇舰首和舰尾明显的被怪兽缠绕的变了形。187号驱逐舰正用舰上的密集阵火炮向海怪射击，密集阵火炮专门是驱逐舰最后一道防线，由7根30mm炮管组成，射速可达到10000发/分钟。密集阵火炮虽然撕不破海怪的身体，但密集的子弹击打在上面，也让海怪承受不住。徐永源指挥着185号驱逐舰刚掉头，导弹快艇已经被187号舰成功的解救出来。解救出来的导弹快艇舰首和舰尾已经严重变形，船身也开始浸水，不得不退出战斗。
可这边的困局刚解，另一边又出现了新的状况，一艘056型护卫舰610号受到海怪袭击。056型护卫舰满载的排水量达2000吨，海怪无法撞击和缠绕，它们聪明的选择攻击护卫舰吃水线下的动力装置，海怪绞断了螺旋桨与舰身相连的横杆，令到610号护卫舰失去动力，接着又向着护卫舰的喷射能腐蚀船体的毒液，致使610号护卫舰的船体破损，已有海水浸入，再不处理，护卫舰支撑不了多久。
听到这个消息后，徐永源舰长当场被吓得魂飞魄散，动力装置可是所有舰艇的弱点，如果海怪都采用这样的方法破坏船只，那么整支舰队没有一艘军舰能够逃得出海怪的魔掌。现在船队面临的不是剿灭了怪兽，反而有可能出现全军覆没的危险。徐永源也是个狠人，当即命令所有的军舰退出战场，自己则率领着乘坐的185号驱逐舰前去救援。每一艘军舰都是国家宝贵的财产，价值不菲，制造不容易，在没有找出有效对付海底怪兽办法之前，尽量的要保证舰船自身的安全。
当然，徐永源船长也没有忘记把自己的决定向总参汇报。海卫市海域发生的战斗时，有无人驾驶飞机在全程的监控，总参的作战室知道海域发生的一切，他们同意了徐永源决定，只是要求尽可能的把610号护卫舰安全带回港口。
徐永源指挥着185号驱逐舰谨慎的向610号靠拢，失去动力的610号护卫舰如浮萍般的在大海中飘浮着，孑然凄凉。610号上的深水炸弹和反潜火箭弹在先前战斗中已经用完，此时只能用舰首的70mm口径舰炮有一发没一发的发射着炮弹，无力的攻击着海中怪兽。舰炮是有仰角的，对围绕在舰体周边的海怪没有威胁。在610号舰附近的海域，成群结队的聚集着密密麻麻的怪兽，透过湛蓝海水望下去，怪兽黑魆魆的背脊层层叠叠垒在一起，那情形令人惊悚。徐永源所乘坐的185号舰，偃旗息鼓地悄然接近610号护卫舰，没有进一步的去刺激海底怪兽。
610号护卫舰虽然没有动力，但其他的设备依然可以使用，徐永源跟610号护卫舰舰长已做好沟通，由610号继续的吸引怪兽，掩护185号驱逐舰的行动。
在距离610号还有两海里的时候，185号舰的舰载直升机就把缆绳送到了610号舰上，两艘一起开动绞缆车，一条粗大的缆绳唰的一下从海里升起，那动静引得海里的怪兽蠕动的更加的厉害。185号舰的排水量是610号护卫舰的5倍，此时又开足马力，610号舰被缓缓的带动起来，速度慢慢的加快。
海怪当然不会放过自己的猎物，数根出长长的触须从海里伸出来搭在610号舰的船弦，企图再次把610号舰拽停。在缆绳成攻连通610号舰后，185舰再不需隐藏自己，舰上密集阵火炮向着怪兽触须发射出密集的子弹。610舰和185舰的舰载直升机此时也把仅乘的深水炸弹抛入海中，迟滞怪兽的行动。由于海怪与610舰靠得太近，185号火炮虽然成功制止怪兽阻拦610舰的行动，但还是有不少炮弹落在了610舰的侧弦上，把610舰侧弦钢板打成马蜂窝。采用这种杀敌一万，自损七千的战法也是没办法的事，至少将损害降低到最低，不至于让610舰落入海怪魔掌。
天空中有更多的飞机赶过来助战，直升机和歼击机都有，在各方共同努力下，610号护卫舰艰难地成功到达港口。
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